More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2918 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  67.72 
 
 
859 aa  1055    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1616    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  80.24 
 
 
2036 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  78.23 
 
 
1882 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  79.84 
 
 
1120 aa  396  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  78.23 
 
 
1969 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  77.91 
 
 
1682 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  77.82 
 
 
1300 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  76.71 
 
 
2122 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  75.92 
 
 
679 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  67.47 
 
 
581 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  76.71 
 
 
2272 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  77.02 
 
 
1241 aa  386  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  75.9 
 
 
2000 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  56.06 
 
 
547 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  75.5 
 
 
575 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  75.4 
 
 
1842 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  76.23 
 
 
713 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  76.23 
 
 
685 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  74.3 
 
 
978 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  67.81 
 
 
658 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  73.17 
 
 
669 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  76.02 
 
 
752 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  72.98 
 
 
675 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  70.4 
 
 
561 aa  361  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  73.17 
 
 
735 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  76.13 
 
 
551 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  66.54 
 
 
1094 aa  331  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.89 
 
 
615 aa  319  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.56 
 
 
1667 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  48.91 
 
 
1732 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  54.94 
 
 
3295 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  53.57 
 
 
1236 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  77.25 
 
 
184 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  51.81 
 
 
528 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.34 
 
 
910 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.99 
 
 
1356 aa  249  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50.61 
 
 
1361 aa  247  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  52.19 
 
 
1862 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.19 
 
 
930 aa  243  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  68.75 
 
 
560 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.6 
 
 
963 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  49.8 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.55 
 
 
1282 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  44.48 
 
 
941 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  67.7 
 
 
644 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.2 
 
 
2554 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.99 
 
 
838 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.79 
 
 
460 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  45.77 
 
 
930 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.81 
 
 
958 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.99 
 
 
1667 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  45.49 
 
 
1528 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  46.52 
 
 
869 aa  203  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46 
 
 
2552 aa  200  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.51 
 
 
861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42.68 
 
 
823 aa  197  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.7 
 
 
719 aa  193  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 
840 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 
819 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.56 
 
 
870 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  34.95 
 
 
845 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 
777 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.57 
 
 
802 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.15 
 
 
786 aa  187  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  45.78 
 
 
1387 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  42.06 
 
 
1292 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  46.61 
 
 
971 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.87 
 
 
1783 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  54.82 
 
 
519 aa  177  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  38.49 
 
 
1189 aa  174  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.71 
 
 
439 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  44.26 
 
 
1095 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.24 
 
 
443 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  43.53 
 
 
1531 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  41.3 
 
 
938 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.78 
 
 
500 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  48.68 
 
 
1231 aa  157  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.4 
 
 
929 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  42.4 
 
 
816 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  54.55 
 
 
1328 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  40.93 
 
 
1011 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  49.44 
 
 
996 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  33.94 
 
 
1380 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.39 
 
 
848 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.91 
 
 
1931 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40 
 
 
821 aa  151  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  35.42 
 
 
952 aa  151  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.85 
 
 
2176 aa  151  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  49.39 
 
 
769 aa  144  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  50.91 
 
 
1311 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  37.55 
 
 
865 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  43.1 
 
 
684 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  39.45 
 
 
408 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.02 
 
 
1814 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  44.58 
 
 
400 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  40.89 
 
 
1620 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  38.35 
 
 
1987 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  38.4 
 
 
1602 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  45.29 
 
 
940 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>