More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2898 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  48.86 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  48.49 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  48.16 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46.75 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  47.73 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  44.82 
 
 		 309 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  43.55 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  47.1 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  42.39 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  42.39 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.39 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.39 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  42.39 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  42.39 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  42.39 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  42.07 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  42.07 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  42.39 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  43.31 
 
 		 318 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  44.16 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  44.16 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  41.97 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.48 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  41.06 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  40.52 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  41.64 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  42.96 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.03 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.94 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.3 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.41 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  45.81 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  40.38 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  42.26 
 
 		 555 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.45 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.45 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.6 
 
 		 427 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.58 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40 
 
 		 556 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.61 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.31 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  39.42 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  44.3 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  37.91 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  41.58 
 
 		 345 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  39.02 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.83 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.78 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.51 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  38.89 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  38.96 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  41.47 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  37.99 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  37.99 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  42.91 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  37.99 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.16 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  34.6 
 
 		 547 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.94 
 
 		 579 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  38.39 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  37.91 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  39.37 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  39.48 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  39.07 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>