More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2838 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  100 
 
 		 324 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  33.55 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  35.91 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.04 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  33.11 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  33 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  34.12 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  31.88 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  31.96 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  32.99 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  35.25 
 
 		 296 aa  133  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  30.77 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  34.93 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  31.27 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  30.1 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  26.88 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 294 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.93 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.15 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.88 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  25.41 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  25.63 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.62 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.92 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  27 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  26.54 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.75 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.45 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.2 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  24.73 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25.77 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.71 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  25.79 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  25.08 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.71 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  24.44 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  25.55 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  25.27 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.8 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.63 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.56 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.39 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  25.16 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  30.2 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  27.24 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  23.6 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  28.09 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  23.48 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  26.96 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  25.36 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  27.68 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.57 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  25.74 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  23.4 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.3 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  26.21 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  26.51 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  25.37 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>