More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2794 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1112    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  74.5 
 
 		 1120 aa  620  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  88.29 
 
 		 961 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  46.94 
 
 		 2122 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  83.53 
 
 		 752 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  78.63 
 
 		 679 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  76.65 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  77.24 
 
 		 581 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  78.14 
 
 		 2036 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  78.37 
 
 		 1300 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  76.73 
 
 		 1882 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  76.21 
 
 		 685 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  67.44 
 
 		 1682 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  76.52 
 
 		 713 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  78.86 
 
 		 658 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  76.4 
 
 		 669 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  75.51 
 
 		 1842 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  77.14 
 
 		 1969 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  76.11 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  74.49 
 
 		 978 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  74.9 
 
 		 2272 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  74.09 
 
 		 2000 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  76.13 
 
 		 791 aa  360  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  74 
 
 		 735 aa  359  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  73.68 
 
 		 1241 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  75.82 
 
 		 561 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  72.69 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  63.82 
 
 		 859 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  68.29 
 
 		 1094 aa  316  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  64.12 
 
 		 615 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  57.72 
 
 		 1667 aa  287  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.31 
 
 		 3295 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  53.44 
 
 		 1361 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.33 
 
 		 1732 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.22 
 
 		 1356 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.19 
 
 		 1236 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  75.76 
 
 		 560 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  50.2 
 
 		 1862 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50.2 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  46.84 
 
 		 910 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.78 
 
 		 930 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  74.53 
 
 		 644 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.98 
 
 		 1282 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  74.39 
 
 		 184 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44.14 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.79 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 		 2554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  49.6 
 
 		 838 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  50 
 
 		 963 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  43.58 
 
 		 958 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.61 
 
 		 861 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.06 
 
 		 2552 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.99 
 
 		 1667 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  44.58 
 
 		 1528 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  48.78 
 
 		 941 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.37 
 
 		 719 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.5 
 
 		 930 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42.08 
 
 		 823 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.44 
 
 		 845 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.84 
 
 		 870 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.39 
 
 		 840 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.25 
 
 		 802 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.15 
 
 		 786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.73 
 
 		 1292 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.27 
 
 		 1387 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.32 
 
 		 819 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 777 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.27 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.75 
 
 		 971 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  54.94 
 
 		 519 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.59 
 
 		 1095 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.41 
 
 		 439 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.59 
 
 		 1531 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.58 
 
 		 443 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.06 
 
 		 1783 aa  166  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  38.43 
 
 		 952 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.2 
 
 		 1189 aa  163  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  41.38 
 
 		 938 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  47.06 
 
 		 1231 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  33.64 
 
 		 1380 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.48 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  41.11 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  39.15 
 
 		 1011 aa  156  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.79 
 
 		 1814 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  51.18 
 
 		 1328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  41.15 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.67 
 
 		 1931 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  40.66 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.29 
 
 		 848 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  41.74 
 
 		 1602 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.93 
 
 		 2176 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  38.89 
 
 		 1987 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  45.2 
 
 		 816 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  37 
 
 		 865 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  47.22 
 
 		 996 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  40.82 
 
 		 1620 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  45.11 
 
 		 1311 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  46.63 
 
 		 769 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  41.11 
 
 		 684 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  43.37 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>