143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2737 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  50.18 
 
 
302 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  49.64 
 
 
283 aa  288  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  45.85 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  39.78 
 
 
279 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
280 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  41.54 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  39.01 
 
 
283 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  41.92 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37 
 
 
287 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  37.05 
 
 
274 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
298 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
319 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  31.27 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  34.78 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  32.47 
 
 
291 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  30.43 
 
 
280 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  28.83 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.17 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  28.63 
 
 
274 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  29.47 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.13 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  33.08 
 
 
270 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
275 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  29.53 
 
 
286 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.87 
 
 
268 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  30.32 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.43 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.43 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  27.3 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.75 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  30.09 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  36.84 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  36.6 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.71 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  26.7 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  36.18 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  30.73 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  25.55 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  22.36 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  23.36 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  31.4 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  24.31 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  22.43 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  30.24 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.52 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.03 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  28.51 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.32 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  26.54 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.26 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  25.23 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  22.02 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  25.11 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  23.26 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  25.99 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  26.74 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  32.52 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  24.39 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  22.5 
 
 
302 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  22.35 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  24.82 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  24.12 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  40 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  23.6 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.79 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  26.23 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  27.66 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  32.05 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  22.93 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.85 
 
 
420 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
218 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
203 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  35.05 
 
 
253 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3924  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.96 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  32.14 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  29.41 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  31.51 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2602  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  22.6 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.14 
 
 
352 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  30.14 
 
 
244 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2284  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.55 
 
 
225 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2479  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  30.21 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.41 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.51 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3103  Methyltransferase type 12  22.7 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00714601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  28.09 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0697  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  26.56 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0276525  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  22.33 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0789  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  26.09 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0912  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.35 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25.89 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0800  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  26.09 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0882  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  29.35 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>