More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2729 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  100 
 
 		 456 aa  942    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  48.47 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  46.17 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  42.26 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 		 470 aa  358  8e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  41.23 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 480 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.57 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  38.07 
 
 		 467 aa  282  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 		 476 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  36.52 
 
 		 470 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.91 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.03 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  36.38 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.7 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.17 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.17 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.05 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 459 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  34.96 
 
 		 479 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 466 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.64 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  36.2 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.42 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  35.17 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  32.83 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.67 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.05 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.78 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  32.49 
 
 		 464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  32.21 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.89 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 451 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 		 442 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  30.44 
 
 		 470 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  31.14 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  36.64 
 
 		 244 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 		 246 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  31.56 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 244 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 243 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  27.65 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  32.93 
 
 		 251 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 243 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 243 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 243 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  30.17 
 
 		 235 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  30.17 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>