More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2691 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  100 
 
 		 800 aa  1654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  52.7 
 
 		 1182 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 936 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  63.44 
 
 		 886 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  42.28 
 
 		 1289 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  50.15 
 
 		 945 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  67.08 
 
 		 1248 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 1047 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  61.94 
 
 		 819 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  61.76 
 
 		 657 aa  293  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 746 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  61.09 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  60.08 
 
 		 918 aa  277  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 964 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  54.55 
 
 		 754 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 		 721 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 704 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 1758 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  54.26 
 
 		 1210 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 1341 aa  232  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  47.25 
 
 		 1265 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.69 
 
 		 1047 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 2072 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 		 1047 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 1255 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  49.79 
 
 		 449 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 492 aa  211  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 682 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 892 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 		 834 aa  204  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 1028 aa  194  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 991 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 3706 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 767 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 903 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3647  hypothetical protein  50.29 
 
 		 305 aa  180  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  44.07 
 
 		 783 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 689 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  25.28 
 
 		 1239 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 727 aa  170  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 1093 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 462 aa  167  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 1093 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 572 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 1177 aa  161  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 814 aa  160  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.53 
 
 		 1668 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  38.14 
 
 		 744 aa  160  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 1676 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 839 aa  158  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 723 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.53 
 
 		 1663 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 815 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 547 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 631 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 945 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 802 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 771 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 1246 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 1714 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1253 aa  151  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 980 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 681 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 941 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 551 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 215 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 347 aa  144  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 912 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 1560 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3111  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  35.05 
 
 		 213 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1053  sensor domain-like protein  33.33 
 
 		 258 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 732 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 746 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 909 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 1051 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 932 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 771 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 913 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 764 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 		 1390 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 782 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  34.47 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 878 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 524 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 439 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 1051 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 674 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 532 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 382 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  40.59 
 
 		 650 aa  127  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 1093 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>