More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2652 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  45.96 
 
 
825 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  100 
 
 
919 aa  1903    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
751 aa  299  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 
991 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.49 
 
 
1186 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
454 aa  213  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.6 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  32.13 
 
 
1328 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
1215 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.57 
 
 
767 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.76 
 
 
771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.18 
 
 
568 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
568 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30.19 
 
 
2145 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.55 
 
 
1424 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 
911 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.29 
 
 
885 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.4 
 
 
787 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  30.75 
 
 
822 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
1105 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
843 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
924 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.44 
 
 
1039 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
444 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 
1288 aa  167  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.51 
 
 
1550 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 
1040 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 
1507 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.17 
 
 
1228 aa  151  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 
725 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
1290 aa  148  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.64 
 
 
694 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
949 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.21 
 
 
1131 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
284 aa  144  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
443 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.64 
 
 
732 aa  141  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 
799 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.57 
 
 
919 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  36.6 
 
 
311 aa  139  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 
1262 aa  137  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.29 
 
 
1056 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.09 
 
 
1044 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.45 
 
 
1106 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  31.72 
 
 
362 aa  135  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.57 
 
 
1050 aa  134  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0785  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 
1160 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.48 
 
 
1404 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 
828 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
814 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 
782 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30 
 
 
672 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.57 
 
 
740 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
669 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.68 
 
 
1475 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.51 
 
 
977 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.91 
 
 
1488 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
953 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.57 
 
 
1212 aa  124  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
1088 aa  122  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
1185 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  23.93 
 
 
1068 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  30.13 
 
 
1238 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.89 
 
 
680 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
1028 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
481 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
937 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 
1128 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 
1266 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.08 
 
 
2327 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
649 aa  110  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  24.55 
 
 
708 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  33.84 
 
 
212 aa  107  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.6 
 
 
854 aa  106  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1060 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
857 aa  104  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
667 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.02 
 
 
686 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.23 
 
 
2413 aa  101  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.61 
 
 
1036 aa  101  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  23.38 
 
 
836 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
1054 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
966 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 
985 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.84 
 
 
841 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 
991 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  24.84 
 
 
807 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  23.7 
 
 
1435 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
190 aa  95.1  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.9 
 
 
1009 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25.08 
 
 
963 aa  94  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
469 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
1125 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.46 
 
 
968 aa  90.1  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.99 
 
 
828 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 
900 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
1054 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
1313 aa  88.6  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
577 aa  87.8  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>