More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2604 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 927 aa  1845    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  45.52 
 
 		 1694 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.08 
 
 		 1276 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 4079 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.19 
 
 		 1056 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 1022 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.42 
 
 		 1056 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.19 
 
 		 1979 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 988 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1049 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1138 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1069 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 878 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 602 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 543 aa  363  6e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1676 aa  358  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.37 
 
 		 810 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 562 aa  346  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 		 1056 aa  336  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 		 818 aa  312  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 617 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 1013 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.45 
 
 		 784 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  33.4 
 
 		 564 aa  293  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 		 784 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  41.87 
 
 		 573 aa  290  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 1737 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.86 
 
 		 1067 aa  281  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.1 
 
 		 462 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.2 
 
 		 576 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 750 aa  271  5.9999999999999995e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 804 aa  269  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1297 aa  266  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 591 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 605 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 366 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 2240 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 465 aa  249  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.93 
 
 		 632 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  40.66 
 
 		 397 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1421 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 3172 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.46 
 
 		 706 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  34.7 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.73 
 
 		 707 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  35.86 
 
 		 745 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 425 aa  233  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.27 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 711 aa  222  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 687 aa  221  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 635 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  39.18 
 
 		 1007 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  25.78 
 
 		 791 aa  211  6e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 523 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  23.09 
 
 		 2059 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 409 aa  205  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 414 aa  205  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 955 aa  204  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 3035 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 436 aa  202  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  27.4 
 
 		 643 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 4489 aa  201  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 3301 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.1 
 
 		 2145 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.33 
 
 		 732 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 935 aa  197  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 344 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  37.58 
 
 		 750 aa  195  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 1192 aa  195  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.93 
 
 		 1154 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 594 aa  192  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  35.18 
 
 		 314 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 738 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 909 aa  191  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 329 aa  190  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 467 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 1486 aa  189  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 512 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1094 aa  188  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 356 aa  187  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 565 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 409 aa  187  9e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 392 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 361 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 1276 aa  184  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.39 
 
 		 582 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.83 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.61 
 
 		 936 aa  182  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 486 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  34.19 
 
 		 334 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.32 
 
 		 623 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.52 
 
 		 292 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 363 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 391 aa  178  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 649 aa  178  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 306 aa  178  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 		 985 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>