27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2600 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  373  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0784  nuclear protein SET  51.3 
 
 
132 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.348835  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1319  nuclear protein SET  43.36 
 
 
122 aa  103  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0660  nuclear protein SET  45.69 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.388607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2004  nuclear protein SET  41.67 
 
 
129 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216371  normal  0.103279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4900  nuclear protein SET  44 
 
 
131 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0031  SET domain protein  44 
 
 
131 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4938  SET domain-containing protein  45 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.490583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4781  SET domain-containing protein  45 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4799  SET domain-containing protein  45 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5316  set domain-containing protein  45 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5213  SET domain-containing protein  45 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5183  SET domain protein  45 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5217  SET domain protein  45 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5232  SET domain protein  45 
 
 
131 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3648  nuclear protein SET  44 
 
 
129 aa  84.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.598458  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04270  hypothetical protein  30.7 
 
 
647 aa  65.1  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0242249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1482  nuclear protein SET  35.04 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1496  nuclear protein SET  32.43 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.257167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1240  nuclear protein SET  37.27 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  32.11 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1635  nuclear protein SET  29.2 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.211469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1274  nuclear protein SET  29.2 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1126  nuclear protein SET  28.57 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_7553  predicted protein  33.01 
 
 
121 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328111  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  27.04 
 
 
628 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2693  hypothetical protein  70.37 
 
 
63 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21506  normal  0.157244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>