More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2576 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  47.83 
 
 		 840 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  73.77 
 
 		 794 aa  1201    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.36 
 
 		 776 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  45.6 
 
 		 816 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  45.61 
 
 		 786 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 802 aa  1624    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  48 
 
 		 774 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.66 
 
 		 835 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.3 
 
 		 776 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.36 
 
 		 776 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  69.64 
 
 		 794 aa  1103    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.04 
 
 		 773 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  46.66 
 
 		 835 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  46.27 
 
 		 843 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  63.84 
 
 		 797 aa  1028    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 		 797 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 812 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.17 
 
 		 776 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 810 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  70.55 
 
 		 793 aa  1158    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 801 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.21 
 
 		 828 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.78 
 
 		 773 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.91 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.91 
 
 		 776 aa  635  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  47.04 
 
 		 797 aa  635  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.23 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  45.27 
 
 		 785 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  45.27 
 
 		 785 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 		 817 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  45.01 
 
 		 781 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 		 773 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 785 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 785 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  48.24 
 
 		 775 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 785 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  43.07 
 
 		 846 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.01 
 
 		 785 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.01 
 
 		 785 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.01 
 
 		 785 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  45.14 
 
 		 785 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  45.53 
 
 		 810 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 785 aa  628  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 784 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  44.57 
 
 		 783 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 786 aa  628  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  44.56 
 
 		 797 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  46.51 
 
 		 778 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 787 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 793 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  44.04 
 
 		 782 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.4 
 
 		 786 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  52.32 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 		 775 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 793 aa  625  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  44.49 
 
 		 803 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 		 805 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 811 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.49 
 
 		 806 aa  621  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 		 783 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 785 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.85 
 
 		 812 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.04 
 
 		 773 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.83 
 
 		 785 aa  622  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 837 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 813 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 		 801 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.73 
 
 		 823 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 783 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.75 
 
 		 815 aa  615  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 792 aa  615  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.94 
 
 		 817 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.16 
 
 		 799 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  44.32 
 
 		 783 aa  616  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 819 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  49.38 
 
 		 804 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 867 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  43.86 
 
 		 788 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.68 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 805 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  43.43 
 
 		 789 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 804 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  44.42 
 
 		 787 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.11 
 
 		 784 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 804 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.11 
 
 		 784 aa  612  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>