189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2548 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  100 
 
 
130 aa  254  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  63.46 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  70.73 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  48.33 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.12 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.6 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.04 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  59.57 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.33 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.13 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.97 
 
 
97 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.53 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  61.54 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.06 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
193 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.02 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  53.06 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  58.54 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  51.02 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.17 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  55.32 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  58.97 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  50.94 
 
 
102 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  55.32 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.85 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.97 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.94 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.37 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
207 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.85 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  52.5 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  52.5 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.5 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  55.26 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  56.41 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.28 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.05 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  51.28 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  47.37 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.97 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.08 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  53.85 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  53.85 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.28 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  46.94 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  54.76 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.45 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.45 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.53 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  45.61 
 
 
200 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.8 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  43.86 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  43.48 
 
 
57 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.69 
 
 
234 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
77 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.28 
 
 
64 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  51.11 
 
 
89 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  48.72 
 
 
96 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  43.86 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  45.61 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  48.72 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  35.71 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.57 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.72 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.29 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0173138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  51.22 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  45.61 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  39.58 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  54.05 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.28 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.76 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  48.28 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.72 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  54.05 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.18 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>