45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2535 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  100 
 
 		 73 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  72.22 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  71.23 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  67.12 
 
 		 60 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0190  hypothetical protein  71.15 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  67.92 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  66.04 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2425  hypothetical protein  69.49 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.989254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0232  hypothetical protein  72.55 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.939716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0033  hypothetical protein  72.55 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  56.34 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0593  hypothetical protein  71.43 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0657  hypothetical protein  76.92 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0656  hypothetical protein  76.92 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229933  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  61.54 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  52.73 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  57.41 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  54.39 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  62.5 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  56.6 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  72.97 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  55.81 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  62.5 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  52.08 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  53.7 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  51.16 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  51.11 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  52.5 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  52.5 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  49.06 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  60.53 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  56.41 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  43.64 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  54.76 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  55.26 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  45.31 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  45.31 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  59.38 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  46.34 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1492  hypothetical protein  51.28 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  44.74 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>