More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2460 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  35.06 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  33.95 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 541 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 541 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  33.33 
 
 		 541 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 541 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.9 
 
 		 541 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  24.14 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  30.72 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  30.72 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.72 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 675 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  30.72 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30.72 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  30.07 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  21.9 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  26.64 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  32.79 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.41 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.58 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  43.06 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.76 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  27.45 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  32.82 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  31.78 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  33.64 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  43.06 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 199 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  35.96 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.66 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.7 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.78 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1085 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.06 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  25.25 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.83 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.5 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  28.35 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.73 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  29.63 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  29.63 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  21.12 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  29.25 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>