39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2432 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.28 
 
 
171 aa  207  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  61.25 
 
 
157 aa  201  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.49 
 
 
163 aa  198  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.94 
 
 
172 aa  192  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.52 
 
 
167 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  53.42 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  53.29 
 
 
167 aa  175  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  51.55 
 
 
168 aa  167  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  47.71 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  49.04 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  45.19 
 
 
114 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  44.23 
 
 
114 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  48.08 
 
 
110 aa  103  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  46.08 
 
 
114 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  45.54 
 
 
111 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  36.59 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  41.43 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  35.37 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  38.24 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  42.03 
 
 
93 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  36.59 
 
 
93 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  31.52 
 
 
582 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  34.78 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  31.68 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  29.7 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  44.74 
 
 
884 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  34.78 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  39.13 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  39.13 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  39.13 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
209 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  50 
 
 
214 aa  42  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.71 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  29.31 
 
 
392 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  36.96 
 
 
215 aa  40.8  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  35.48 
 
 
233 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>