More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2425 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  100 
 
 		 129 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  77.17 
 
 		 144 aa  219  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  77.17 
 
 		 142 aa  219  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  77.95 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  78.74 
 
 		 143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  79.03 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  80.8 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  75.4 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  73.11 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.67 
 
 		 127 aa  187  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.27 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.27 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  68.85 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.77 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.32 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.11 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  65 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  66.39 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.87 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.5 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  60.98 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.34 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  63.79 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  67.21 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.86 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  62.9 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  60.48 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  54.62 
 
 		 139 aa  146  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  53.44 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.2 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  55.81 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 286 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 284 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 291 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  56.3 
 
 		 291 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  55.12 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  54.62 
 
 		 312 aa  141  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  55.74 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  55.12 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.6 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.47 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  53.85 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  54.1 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  53.85 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  53.85 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 298 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.54 
 
 		 284 aa  140  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.69 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.69 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  54.76 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  55.47 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  54.4 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  53.49 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  55.56 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  52.38 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.49 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.12 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  52.76 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  54.4 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  54.69 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.54 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  54.76 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  52.31 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  53.54 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>