More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2424 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  100 
 
 
404 aa  828  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  67.87 
 
 
393 aa  559  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  64.01 
 
 
399 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  65.36 
 
 
398 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  63.33 
 
 
394 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  64.78 
 
 
396 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  64.68 
 
 
394 aa  516  1e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  63.52 
 
 
384 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  63.52 
 
 
384 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  63.24 
 
 
396 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  61.93 
 
 
398 aa  507  1e-142  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  61.93 
 
 
398 aa  507  1e-142  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  62.83 
 
 
398 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  63.38 
 
 
393 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  62.3 
 
 
390 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  60.16 
 
 
392 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  62.04 
 
 
398 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  59.01 
 
 
392 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  60.05 
 
 
402 aa  468  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  62.86 
 
 
392 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  56.77 
 
 
398 aa  459  1e-128  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  60 
 
 
382 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  59.58 
 
 
394 aa  453  1e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  56.77 
 
 
414 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.55 
 
 
409 aa  439  1e-122  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  55.99 
 
 
400 aa  438  1e-122  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  56.4 
 
 
403 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  54.97 
 
 
382 aa  428  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  51.83 
 
 
388 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.4 
 
 
396 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  53.25 
 
 
389 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  51.52 
 
 
395 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.86 
 
 
400 aa  399  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  51.96 
 
 
400 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  51.71 
 
 
380 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  51.99 
 
 
381 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.44 
 
 
396 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.44 
 
 
398 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.93 
 
 
379 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  51.18 
 
 
404 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.71 
 
 
401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  51.04 
 
 
401 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
393 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  51.04 
 
 
401 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.48 
 
 
388 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
383 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.52 
 
 
407 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  49.48 
 
 
386 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.96 
 
 
394 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.45 
 
 
406 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  50.93 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.7 
 
 
402 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.22 
 
 
417 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  51.2 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.56 
 
 
383 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  51.06 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.5082e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  50.93 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.02151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 
399 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
389 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
391 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
389 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.74 
 
 
388 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  50.13 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  49.35 
 
 
389 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.87 
 
 
404 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
400 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.69 
 
 
384 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  45.01 
 
 
403 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  48.68 
 
 
402 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  48.29 
 
 
388 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.95 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.47846e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  49.48 
 
 
388 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
381 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.7 
 
 
403 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  48.45 
 
 
507 aa  362  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.16 
 
 
388 aa  362  7e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  50.39 
 
 
386 aa  362  7e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  47.77 
 
 
388 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  45.9 
 
 
436 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  45.9 
 
 
436 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  46.77 
 
 
403 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.42 
 
 
400 aa  360  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  47.64 
 
 
407 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
391 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.91 
 
 
391 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.4 
 
 
394 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.99 
 
 
403 aa  357  2e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  47.35 
 
 
395 aa  357  3e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  46.86 
 
 
407 aa  356  3e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  46.11 
 
 
389 aa  356  4e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.09 
 
 
400 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  47.01 
 
 
399 aa  353  3e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.12 
 
 
407 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  46.86 
 
 
407 aa  352  6e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>