More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2385 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  40.36 
 
 
386 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  37.43 
 
 
381 aa  262  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  37.69 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  31.58 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  40.42 
 
 
367 aa  236  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  39.37 
 
 
430 aa  225  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  34.75 
 
 
397 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  33.08 
 
 
397 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  31.45 
 
 
408 aa  215  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  32.32 
 
 
396 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  32.09 
 
 
402 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  31.62 
 
 
410 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  33.74 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  29.87 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 
448 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  31.04 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.96 
 
 
397 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.73 
 
 
391 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  27.41 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  27.46 
 
 
397 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
406 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25.74 
 
 
397 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.65 
 
 
397 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  28.35 
 
 
397 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  28.1 
 
 
397 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.75 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  28.5 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.21 
 
 
397 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
405 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  25.74 
 
 
397 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  30.26 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.89 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  29.4 
 
 
412 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.02 
 
 
414 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.99 
 
 
401 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.25 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
409 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
410 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  26.96 
 
 
409 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.46 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.47 
 
 
409 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  23.76 
 
 
403 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
443 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
385 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.78 
 
 
398 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  26.65 
 
 
657 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.86 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  27.68 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  26.05 
 
 
657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.4 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  23.28 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.29 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  26.98 
 
 
405 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  24.38 
 
 
400 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.29 
 
 
410 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.07 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  26.73 
 
 
654 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.76 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.88 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  25.56 
 
 
653 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.73 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.56 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.37 
 
 
663 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  24.51 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.63 
 
 
663 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  26.28 
 
 
397 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  24.81 
 
 
658 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.89 
 
 
395 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.96 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  28.93 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.21 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.86 
 
 
414 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  26.33 
 
 
414 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.57 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 
397 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
405 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.94 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  25.89 
 
 
656 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.66 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.4 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.07 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>