More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2384 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
228 aa  463  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  54.67 
 
 
225 aa  252  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.02 
 
 
236 aa  244  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.47 
 
 
230 aa  244  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  52.05 
 
 
231 aa  242  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  52.04 
 
 
232 aa  240  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50 
 
 
253 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.68 
 
 
230 aa  238  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.05 
 
 
225 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
240 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.89 
 
 
226 aa  237  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  54.05 
 
 
226 aa  237  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
226 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.55 
 
 
238 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.45 
 
 
244 aa  235  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
246 aa  234  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
226 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 
222 aa  234  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  49.77 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.9 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.9 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50.45 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  52.51 
 
 
228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.36 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.49 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.32 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.4 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.8 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
222 aa  231  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  50.91 
 
 
235 aa  231  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50 
 
 
226 aa  231  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.6 
 
 
225 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.74 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.65 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.65 
 
 
256 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
248 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 
232 aa  230  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.2 
 
 
260 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
241 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
228 aa  229  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  50.44 
 
 
227 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 
255 aa  229  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.25 
 
 
240 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 
248 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.32 
 
 
229 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  48.2 
 
 
229 aa  229  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.06 
 
 
241 aa  228  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  50.44 
 
 
249 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  49.33 
 
 
230 aa  228  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.11 
 
 
244 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  50.45 
 
 
244 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  49.09 
 
 
234 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  51.11 
 
 
234 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.11 
 
 
247 aa  228  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50.95 
 
 
236 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 
243 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.64 
 
 
234 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 
227 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  46.02 
 
 
228 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.31 
 
 
237 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
228 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.3 
 
 
228 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.64 
 
 
236 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
288 aa  226  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.77 
 
 
252 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  48.64 
 
 
234 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  48.87 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  47.75 
 
 
247 aa  225  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  45.95 
 
 
233 aa  225  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  47.09 
 
 
240 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.93 
 
 
242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  50.23 
 
 
241 aa  224  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 
236 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
236 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.05 
 
 
653 aa  223  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  48.86 
 
 
249 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.98 
 
 
233 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.98 
 
 
642 aa  223  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.53 
 
 
239 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
246 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  45 
 
 
264 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  47.77 
 
 
247 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48.21 
 
 
248 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  48.64 
 
 
226 aa  223  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  50 
 
 
223 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
229 aa  223  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48 
 
 
249 aa  222  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>