45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2351 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  98.41 
 
 		 63 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  87.3 
 
 		 62 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  74.24 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  71.67 
 
 		 60 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  66.04 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  56.52 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2425  hypothetical protein  68 
 
 		 64 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.989254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0232  hypothetical protein  66.67 
 
 		 59 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.939716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0033  hypothetical protein  66.67 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0593  hypothetical protein  70 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  62.96 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0190  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  67  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  63.83 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  68.29 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0657  hypothetical protein  70.73 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0656  hypothetical protein  70.73 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229933  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  59.18 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  58.7 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  53.19 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  56.1 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  52.5 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  53.85 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  40.43 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  62.5 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  48.84 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  54.55 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  33.96 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  47.5 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  55.26 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  39.58 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  39.58 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  36.96 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  42.86 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  51.43 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1492  hypothetical protein  48.65 
 
 		 336 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  37.78 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  48.57 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>