More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2346 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2346  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
223 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0014458  normal  0.0426929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1450  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  61.01 
 
 
219 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1528  undecaprenyl diphosphate synthase, putative  61.32 
 
 
213 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.496423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1809  putative undecaprenyl diphosphate synthase  61.32 
 
 
213 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00748094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0991  Di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  59.55 
 
 
220 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00019103  hitchhiker  0.0000468071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14480  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  56.81 
 
 
214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.47 
 
 
247 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.91 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  30.21 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.69 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  30.87 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  28.39 
 
 
257 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  29.82 
 
 
244 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  28.63 
 
 
242 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  29.96 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  31.44 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  30.87 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  30.13 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  28.21 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  31.17 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  30.87 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.17 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  28.51 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  29.79 
 
 
260 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  31.6 
 
 
266 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.79 
 
 
260 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  29.57 
 
 
276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  29.26 
 
 
256 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  30.43 
 
 
251 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  30.47 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  30.43 
 
 
251 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  30.21 
 
 
260 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  31.22 
 
 
285 aa  111  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  30.64 
 
 
260 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
260 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
260 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
260 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.58 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.47 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  28.22 
 
 
264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.05 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  30.04 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.82 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  29.44 
 
 
256 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  31.28 
 
 
248 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  29.17 
 
 
260 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  29.17 
 
 
260 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  32.03 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  29.15 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  28.94 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.04 
 
 
249 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  25.97 
 
 
245 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  31 
 
 
245 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  26.29 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  29.83 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  29.17 
 
 
260 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  29.57 
 
 
251 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  27.39 
 
 
291 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  28.33 
 
 
265 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  30.94 
 
 
240 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  27.83 
 
 
251 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.36 
 
 
261 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.2 
 
 
252 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  31.02 
 
 
250 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  29.74 
 
 
254 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  29.41 
 
 
243 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  27.98 
 
 
253 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.74 
 
 
252 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.48 
 
 
266 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  28.51 
 
 
257 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  29.82 
 
 
251 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.35 
 
 
241 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1975  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.39 
 
 
258 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.100938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  26.96 
 
 
256 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  29.82 
 
 
250 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  29.57 
 
 
253 aa  104  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.04 
 
 
253 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  28.51 
 
 
268 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  30.17 
 
 
276 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  28.05 
 
 
244 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  28.05 
 
 
244 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  28.94 
 
 
258 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.56 
 
 
233 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  29.57 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  30.43 
 
 
251 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  28.94 
 
 
258 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  28.57 
 
 
247 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  27.23 
 
 
243 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  31.44 
 
 
231 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  31.33 
 
 
248 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  27.63 
 
 
259 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>