More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2310 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  62.35 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  58.62 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  64.56 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  51.72 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  47.67 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.67 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  51.81 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  49.43 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  48.81 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  45.35 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  52.63 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  47.13 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.98 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  44.83 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  49.4 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  47.13 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  45.98 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.98 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  47.62 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  46.51 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  47.13 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  56.52 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  48.28 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  44.83 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  48.24 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  44.05 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  48.28 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  50.57 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  43.68 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  44.19 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  45.98 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  44.19 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  47.13 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  48.84 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.84 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.35 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  43.53 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  44.05 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  46.99 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  41.38 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  41.18 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  56.16 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  44.19 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  48.68 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  44.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  44.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  42.53 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  47.13 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  44.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  45.78 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.86 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  44.71 
 
 		 280 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  47.56 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  42.53 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.19 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  45.98 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.53 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.23 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  44.05 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  48.81 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  47.56 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  48.81 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  48.81 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.02 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  43.53 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  41.38 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  42.53 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  49.32 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  40.7 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.7 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  41.38 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>