More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2283 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  100 
 
 		 173 aa  349  8.999999999999999e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  54.17 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  56.3 
 
 		 500 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  44.78 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  49.69 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  43.79 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  35.88 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  45.61 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  47.27 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  47.46 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.48 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  30.43 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  45.45 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  42.86 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  47.27 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  33.64 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  32.46 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  47.27 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  37.88 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  42.19 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41.82 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  40.35 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  42.11 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  46.03 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  34.12 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  38.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  34.29 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  34.12 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  34.48 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  39.29 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  40.85 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.96 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.7 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.82 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  32.18 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  32.18 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  38.04 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  41.07 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  42.65 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.71 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  32.18 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  43.64 
 
 		 341 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  32.98 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  36.36 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  40.3 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.41 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  36.36 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.71 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  36.92 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  40 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0723  Thioredoxin domain  40.3 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.90537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.78 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0793  Thioredoxin domain protein  40.3 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.195388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  28.16 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  38.71 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  38.67 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  31.87 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  37.1 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  43.64 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  38.46 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  39.29 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  37.7 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36.84 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  38.18 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.88 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  43.64 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  33.73 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  36.84 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  35.48 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  37.31 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  34.38 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  35.8 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  35.94 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  31.18 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  35.21 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  38.6 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>