More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2279 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  100 
 
 
123 aa  244  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  55.65 
 
 
125 aa  141  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  52.46 
 
 
120 aa  137  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  51.64 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
125 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  45.9 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  46.72 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  45.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  43.51 
 
 
126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
128 aa  99  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  40.98 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.38 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  39.69 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  41.8 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  43.44 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.08 
 
 
125 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  43.85 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.51 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.98 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  42.62 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  42.62 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  41.8 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  36.07 
 
 
112 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  41.22 
 
 
125 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
112 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
112 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
112 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  40.98 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.7 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.8 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  40.98 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.7 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.89 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  35.25 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>