More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2225 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  80.62 
 
 
452 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  100 
 
 
458 aa  944    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  69.39 
 
 
448 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  43.12 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.89 
 
 
452 aa  352  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  42.7 
 
 
455 aa  350  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.35 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.15 
 
 
453 aa  343  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  41.67 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  42.6 
 
 
434 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  40.84 
 
 
454 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  38.99 
 
 
454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  39.52 
 
 
454 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  40.32 
 
 
455 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.18 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  40.32 
 
 
458 aa  308  9e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.85 
 
 
453 aa  299  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  37.95 
 
 
449 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  36.3 
 
 
458 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.98 
 
 
442 aa  273  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  38.5 
 
 
446 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  34.6 
 
 
445 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  36.36 
 
 
450 aa  263  6e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  36.26 
 
 
430 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  36.04 
 
 
430 aa  256  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.49 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  33.85 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  34.83 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.31 
 
 
462 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  35.77 
 
 
437 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 
452 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.7 
 
 
447 aa  250  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  35.52 
 
 
437 aa  249  8e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  37.22 
 
 
462 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  33.48 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  35.92 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  34.75 
 
 
467 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.55 
 
 
470 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.97 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34 
 
 
437 aa  240  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.67 
 
 
478 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  36.79 
 
 
460 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.37 
 
 
467 aa  239  8e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.85 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  36.76 
 
 
464 aa  236  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  35.03 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  32.97 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  35.96 
 
 
462 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.01 
 
 
472 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  34.98 
 
 
447 aa  226  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  33.47 
 
 
459 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.59 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  35.84 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  34.95 
 
 
449 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  34.7 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  34.6 
 
 
444 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  34.85 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  33.93 
 
 
451 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  34.68 
 
 
444 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  33.71 
 
 
419 aa  219  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  34.84 
 
 
451 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
444 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  35.48 
 
 
452 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  34.37 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.27 
 
 
419 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 
449 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  33.33 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  31.9 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  33.62 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  32.96 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  33.92 
 
 
449 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  33.98 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  34.72 
 
 
451 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  35.27 
 
 
449 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
451 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
442 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  33.99 
 
 
448 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
451 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.69 
 
 
492 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  34.21 
 
 
448 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  34.64 
 
 
460 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2039  phosphoglucosamine mutase  32.53 
 
 
446 aa  209  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  33.69 
 
 
448 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 
833 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
451 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.83 
 
 
418 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 
450 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  34.32 
 
 
454 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0897  phosphoglucosamine mutase  32.88 
 
 
432 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.05706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  34.14 
 
 
450 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  34.26 
 
 
447 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  31.75 
 
 
453 aa  204  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  33.71 
 
 
455 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
446 aa  203  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.99 
 
 
418 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  34.14 
 
 
450 aa  203  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
451 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  33.4 
 
 
455 aa  202  7e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  34.33 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>