More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2184 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1382    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  50.83 
 
 		 1248 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 704 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  49.4 
 
 		 945 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 886 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 1019 aa  323  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 819 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  44.94 
 
 		 1182 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 936 aa  299  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 746 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  42.89 
 
 		 918 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.35 
 
 		 754 aa  286  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  61.09 
 
 		 800 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  61.86 
 
 		 1289 aa  281  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 1047 aa  281  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  45.99 
 
 		 1210 aa  280  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  47.75 
 
 		 657 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  45.4 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 892 aa  230  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.4 
 
 		 783 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 492 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 681 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 834 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.24 
 
 		 744 aa  211  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 991 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1676 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 1239 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 1093 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1093 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 1051 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 547 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 1253 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 945 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 913 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 613 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 3706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 964 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 980 aa  174  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 932 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 1177 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 839 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 912 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 1390 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 1654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 788 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 1714 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 767 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 815 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 872 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 462 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 723 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 732 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 347 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 771 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1246 aa  150  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 1560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 764 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 693 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 878 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 1051 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.32 
 
 		 1668 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 674 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.36 
 
 		 1663 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 1050 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 790 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 909 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 771 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 631 aa  137  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 215 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1093 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 941 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 1183 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 856 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 782 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 465 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 535 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 524 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 773 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 2693 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 746 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 907 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 739 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 1227 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 630 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 437 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 1171 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 645 aa  127  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>