212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2139 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 482 aa  942    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  37.77 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 		 463 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 517 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 512 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 583 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.94 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 495 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  31.96 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.93 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000392741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.67 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.13 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 506 aa  67  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  21.98 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  22.2 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  21.77 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.88 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  22.42 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  22.2 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.51 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.51 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.6 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  22.88 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  23.21 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  20.92 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  22.95 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  21.38 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>