More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2128 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  100 
 
 		 855 aa  1753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  62.44 
 
 		 780 aa  1061    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  31.7 
 
 		 843 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  32.41 
 
 		 827 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  31.18 
 
 		 747 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.79 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  32.17 
 
 		 771 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.12 
 
 		 837 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  30.95 
 
 		 844 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.52 
 
 		 864 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  32.72 
 
 		 702 aa  364  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 863 aa  359  9e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  36.75 
 
 		 631 aa  352  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 743 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.13 
 
 		 849 aa  348  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  35.55 
 
 		 602 aa  348  3e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.44 
 
 		 610 aa  342  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  35.44 
 
 		 604 aa  340  5e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  29.25 
 
 		 834 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  32.59 
 
 		 931 aa  335  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 744 aa  334  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  30.4 
 
 		 931 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  34.03 
 
 		 604 aa  321  5e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  35.96 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.31 
 
 		 942 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.38 
 
 		 938 aa  303  9e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  30.26 
 
 		 935 aa  302  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  32 
 
 		 863 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  31.34 
 
 		 1009 aa  280  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  28.49 
 
 		 868 aa  278  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  26.86 
 
 		 814 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  30.11 
 
 		 641 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  26.85 
 
 		 812 aa  266  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 		 817 aa  259  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  31.02 
 
 		 828 aa  258  5e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  26.28 
 
 		 814 aa  257  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  30.45 
 
 		 616 aa  254  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 		 853 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  28.04 
 
 		 629 aa  231  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 693 aa  206  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 691 aa  196  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  25.58 
 
 		 697 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.31 
 
 		 693 aa  194  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  25.28 
 
 		 868 aa  190  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 693 aa  190  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  25.5 
 
 		 859 aa  188  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.84 
 
 		 879 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  25.07 
 
 		 743 aa  182  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  24.32 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  26.51 
 
 		 692 aa  180  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  26.51 
 
 		 692 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  26 
 
 		 696 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  26.31 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  25.95 
 
 		 804 aa  179  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 898 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  26.04 
 
 		 868 aa  178  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  25.56 
 
 		 696 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  25 
 
 		 711 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  25.47 
 
 		 694 aa  177  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  26.05 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  25.9 
 
 		 692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  24.62 
 
 		 836 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  25.1 
 
 		 700 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  25.47 
 
 		 700 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  28.29 
 
 		 686 aa  173  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  25.42 
 
 		 869 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  25.6 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  25.75 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  26.15 
 
 		 869 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  26.15 
 
 		 869 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  25.23 
 
 		 836 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  25.5 
 
 		 867 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  25.29 
 
 		 789 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  28.13 
 
 		 718 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  25.97 
 
 		 668 aa  171  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  23.88 
 
 		 694 aa  170  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  24.51 
 
 		 671 aa  170  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  26.51 
 
 		 895 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  23.4 
 
 		 768 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  25.4 
 
 		 697 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 		 903 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  25.82 
 
 		 879 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  24.72 
 
 		 695 aa  169  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  25.42 
 
 		 841 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  25.32 
 
 		 767 aa  168  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  25.04 
 
 		 670 aa  168  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  25.62 
 
 		 869 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  26.6 
 
 		 714 aa  168  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  26.15 
 
 		 702 aa  168  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  24.33 
 
 		 765 aa  168  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  25.85 
 
 		 896 aa  168  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 872 aa  168  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 880 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 880 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 880 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>