14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2114 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  50 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  52.63 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  52.54 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  57.45 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  44 
 
 		 359 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  48.28 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  49.09 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  43.64 
 
 		 358 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  45.28 
 
 		 352 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  40.28 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  40.58 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1797  hypothetical protein  33.82 
 
 		 170 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>