More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2046 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  887    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  43.68 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  37.41 
 
 
438 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  36.06 
 
 
434 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.23 
 
 
1816 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
463 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.29 
 
 
1833 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  29.86 
 
 
449 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.1 
 
 
445 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
432 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
432 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  29.15 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  30.34 
 
 
439 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  29.61 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  28.74 
 
 
432 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.24 
 
 
1829 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
438 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.26 
 
 
1876 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.71 
 
 
1864 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  29.6 
 
 
414 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
448 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.58 
 
 
1839 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
433 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.72 
 
 
1806 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.26 
 
 
2720 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.59 
 
 
1776 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  23.63 
 
 
1769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.52 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  26.68 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.32 
 
 
422 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  25.72 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  25.62 
 
 
405 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.33 
 
 
422 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.74 
 
 
422 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.74 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.81 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  22.66 
 
 
927 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.74 
 
 
422 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.74 
 
 
422 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  26.58 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.61 
 
 
422 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
432 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  26.16 
 
 
425 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  23.63 
 
 
394 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
440 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
432 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.49 
 
 
422 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.3 
 
 
422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  22.55 
 
 
397 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  23.45 
 
 
425 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.86 
 
 
390 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.86 
 
 
390 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  25.76 
 
 
450 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  23.83 
 
 
420 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  23.53 
 
 
397 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.59 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.27 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
407 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.12 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.02 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  30.53 
 
 
134 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.06 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.07 
 
 
417 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.05 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 
415 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 
415 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.82 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.63 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  23.51 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.51 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.58 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.66 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.91 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.77 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.52 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.77 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>