144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2035 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  61.85 
 
 
176 aa  228  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  40.57 
 
 
179 aa  148  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.24 
 
 
160 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.76 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.96 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.54 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  34 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.28 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.12 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  33.12 
 
 
172 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  33.12 
 
 
172 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.3 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.59 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  32.48 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.29 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30.49 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  32.14 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.74 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  30.25 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  29.45 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  35.5 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.45 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.55 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  33.75 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  34 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  31.4 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.63 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.97 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  31.37 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.68 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  34.19 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.33 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.65 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.61 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0522  hypothetical protein  42.62 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.62682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  30.25 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  30.86 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  41.38 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  38.37 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.25 
 
 
152 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.19 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  32.46 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.09 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  33.33 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.32 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.63 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  33.13 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.92 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  28.98 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.1 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  28.14 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  32.93 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  30.77 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.67 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.4 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  29.38 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.67 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.86 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  26.8 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  28.67 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.14 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.56 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.82 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  30.06 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.66 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  38.37 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  33.76 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.15 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.17 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  31.21 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.03 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.15 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  29.94 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.13 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  30.36 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  25.44 
 
 
190 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.95 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  26.74 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  29.94 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  33.88 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.41 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  34.29 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.81 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  26.44 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  26.16 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.58 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  26.74 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  26.16 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>