More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2023 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
405 aa  818    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  60 
 
 
405 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  45.14 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.67 
 
 
400 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  42.17 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  43 
 
 
400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.09 
 
 
393 aa  296  4e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  41.48 
 
 
393 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.91 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.25 
 
 
393 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  38.75 
 
 
396 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  39.79 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  36.36 
 
 
399 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
400 aa  255  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 
403 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  38.82 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  35.64 
 
 
401 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  36.65 
 
 
400 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  41.99 
 
 
374 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  38.01 
 
 
384 aa  235  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  37.82 
 
 
383 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  35.21 
 
 
391 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  38.32 
 
 
384 aa  226  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.59 
 
 
397 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  37.34 
 
 
388 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
391 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  33.99 
 
 
402 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
397 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  36.17 
 
 
411 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
402 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  33.09 
 
 
393 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.5 
 
 
349 aa  209  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
411 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 
411 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
403 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.85 
 
 
393 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.32 
 
 
357 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  33.97 
 
 
414 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  33 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
387 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  29.98 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  28.54 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.45 
 
 
835 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.44 
 
 
351 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.62 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.18 
 
 
439 aa  182  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.5 
 
 
344 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.56 
 
 
357 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.52 
 
 
357 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.52 
 
 
357 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.93 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.15 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.13 
 
 
355 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.81 
 
 
399 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.93 
 
 
392 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
828 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  31.31 
 
 
411 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.62 
 
 
355 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.86 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.86 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.62 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
347 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  30.05 
 
 
835 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  33.33 
 
 
358 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
820 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.83 
 
 
355 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.37 
 
 
830 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.83 
 
 
355 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.31 
 
 
836 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  30.23 
 
 
840 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
404 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 
355 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.21 
 
 
376 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
842 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.09 
 
 
827 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  29.68 
 
 
833 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  29.37 
 
 
818 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  31.67 
 
 
841 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.72 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 
356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.32 
 
 
355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.18 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
810 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  30.23 
 
 
842 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.03 
 
 
357 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.64 
 
 
836 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30.46 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.53 
 
 
354 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.74 
 
 
359 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.24 
 
 
355 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
387 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 
836 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.9 
 
 
842 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  28.89 
 
 
835 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.08 
 
 
364 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.13 
 
 
828 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.32 
 
 
843 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.01 
 
 
348 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>