More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2020 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
397 aa  808  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  66.67 
 
 
396 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  54.8 
 
 
400 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  53.28 
 
 
400 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  54.04 
 
 
400 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  48.48 
 
 
399 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  47.47 
 
 
403 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  47.22 
 
 
400 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  45.32 
 
 
399 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  46.23 
 
 
393 aa  359  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  45.48 
 
 
402 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  47.22 
 
 
400 aa  351  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  45.14 
 
 
401 aa  348  7e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  46.23 
 
 
402 aa  348  8e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  43.43 
 
 
393 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  44.95 
 
 
399 aa  343  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
393 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  43.58 
 
 
439 aa  326  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
393 aa  318  7e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  45.06 
 
 
403 aa  308  1e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  43.56 
 
 
411 aa  302  8e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  43.8 
 
 
411 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  43.27 
 
 
411 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  42.45 
 
 
414 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  43.24 
 
 
411 aa  292  7e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.91 
 
 
405 aa  283  3e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  39.65 
 
 
405 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.15 
 
 
393 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 
393 aa  254  1e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  36.5 
 
 
404 aa  252  8e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.88 
 
 
393 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.83 
 
 
355 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  36.72 
 
 
374 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.43 
 
 
349 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.34 
 
 
376 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.98 
 
 
357 aa  223  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.12 
 
 
344 aa  221  2e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  36.7 
 
 
383 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  37.8 
 
 
374 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
384 aa  217  3e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.16 
 
 
351 aa  216  6e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  3.22504e-15 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  33.57 
 
 
391 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.35 
 
 
357 aa  214  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.24 
 
 
355 aa  214  2e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.35 
 
 
357 aa  214  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  34.95 
 
 
384 aa  213  4e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.76 
 
 
357 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.50762e-07 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.67 
 
 
357 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
397 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.87 
 
 
397 aa  209  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.13 
 
 
355 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.83 
 
 
355 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.84 
 
 
355 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  34.9 
 
 
385 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.71 
 
 
356 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.53 
 
 
355 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.44 
 
 
357 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  37.57 
 
 
358 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  33.76 
 
 
391 aa  202  1e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.43 
 
 
355 aa  201  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.83 
 
 
358 aa  197  2e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.63 
 
 
364 aa  197  2e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
388 aa  197  4e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.44 
 
 
355 aa  196  4e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.97 
 
 
357 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.45 
 
 
358 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.2 
 
 
359 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.65 
 
 
356 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.33 
 
 
355 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.41 
 
 
354 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.71 
 
 
361 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.41 
 
 
355 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.28 
 
 
357 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.55 
 
 
355 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.86 
 
 
361 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  35.14 
 
 
361 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.71 
 
 
358 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.72 
 
 
356 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  33.53 
 
 
784 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  33.53 
 
 
784 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.53 
 
 
784 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.87 
 
 
355 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.11 
 
 
354 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.53 
 
 
784 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  33.53 
 
 
784 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  33.05 
 
 
392 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
854 aa  176  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
392 aa  174  3e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  34.04 
 
 
355 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.15 
 
 
355 aa  172  7e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.84 
 
 
784 aa  172  7e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.84 
 
 
784 aa  172  8e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.93 
 
 
784 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.54 
 
 
833 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.93 
 
 
784 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
325 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
370 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
784 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.17 
 
 
354 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
349 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>