21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2016 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  100 
 
 
868 aa  1744    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0268  S-layer-related protein  48.51 
 
 
867 aa  800    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  51.93 
 
 
1161 aa  822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  49.35 
 
 
1304 aa  787    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  40.7 
 
 
1113 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0677  S-layer-like domain-containing protein  35.52 
 
 
720 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0713079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2011  hypothetical protein  35.24 
 
 
681 aa  307  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1690  S-layer-related protein  32.16 
 
 
677 aa  298  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.351956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1177  S-layer-like domain-containing protein  31.6 
 
 
874 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1758  hypothetical protein  33.03 
 
 
668 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  30.37 
 
 
1096 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1577  hypothetical protein  25.76 
 
 
744 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1775  hypothetical protein  24.84 
 
 
586 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664356  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1816  hypothetical protein  25.05 
 
 
505 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0271443  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1815  hypothetical protein  33.15 
 
 
617 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1089  cell surface protein  25.83 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415755  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0524  hypothetical protein  28.76 
 
 
463 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.195293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  29.79 
 
 
519 aa  45.8  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  34.38 
 
 
1578 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  35.24 
 
 
1374 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3508  hypothetical protein  30 
 
 
394 aa  44.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>