57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2012 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  47.02 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 248 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2801  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 214 aa  94  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  33.1 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  31.33 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  31.41 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  33.59 
 
 		 273 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  26.09 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  30.28 
 
 		 249 aa  84.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2989  transcription regulator  29.33 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  29.55 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  32.59 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  33.59 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  30.71 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.94 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  29.87 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  32.58 
 
 		 285 aa  77.8  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  31.11 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  28.28 
 
 		 244 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0944  transcriptional regulator, ArsR family  26.22 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0139266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2687  transcriptional regulator, ArsR family  28.48 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1645  ArsR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.69 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1276  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.121315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1281  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0435937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  27.2 
 
 		 385 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  23.81 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  22.48 
 
 		 242 aa  47.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  30.38 
 
 		 239 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4356  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.871364  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  25.64 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2910  transcriptional regulator, ArsR family  30.88 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.77 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  25 
 
 		 247 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 114 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3526  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 101 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  29.63 
 
 		 117 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 		 417 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 116 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>