More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2002 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  303  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  60.39 
 
 
154 aa  201  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  53.25 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  45.81 
 
 
158 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  43.79 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  45.1 
 
 
161 aa  138  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  41.18 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  43.33 
 
 
153 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  42 
 
 
153 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  41.33 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  40.67 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  36.36 
 
 
155 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  38.22 
 
 
161 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.45 
 
 
230 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  35.44 
 
 
230 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.12 
 
 
242 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  35.57 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  38.36 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.91 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.91 
 
 
230 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  31.79 
 
 
219 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.7 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  35.06 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  31.72 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.61 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.48 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  33.33 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  33.33 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.41 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.13 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.24 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.87 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  30.82 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  31.51 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  36 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.17 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.42 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  30.14 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.97 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.95 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  24.52 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.05 
 
 
688 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.26 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.42 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.86 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  30.26 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.82 
 
 
282 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.14 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.87 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.17 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.13 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  29.45 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.03 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  26.49 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.52 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  33.33 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  28.97 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.3 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 
688 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 
221 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.63 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
769 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  25.16 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.53 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  29.05 
 
 
208 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.41 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.49 
 
 
223 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.12 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30.32 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.67 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  32.89 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  26.43 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  32.47 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  33.99 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.87 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  26.53 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>