63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1996 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  100 
 
 
447 aa  905    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  31.87 
 
 
454 aa  266  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  37.06 
 
 
450 aa  262  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.41 
 
 
454 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  32.16 
 
 
454 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.18 
 
 
454 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  30.33 
 
 
453 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  31.33 
 
 
455 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  41.27 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  41.27 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  41.27 
 
 
154 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  40.8 
 
 
125 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  35.25 
 
 
421 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  33.33 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.59 
 
 
349 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2142  restriction endonuclease  21.6 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  29.85 
 
 
305 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  31.16 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  33.58 
 
 
250 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  35.66 
 
 
296 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  32.79 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  29.92 
 
 
219 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  26.43 
 
 
493 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  29.37 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  28.79 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  29.77 
 
 
305 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  35.79 
 
 
208 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.54 
 
 
349 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  26.36 
 
 
285 aa  53.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.03 
 
 
230 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  32 
 
 
304 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.64 
 
 
287 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  33.33 
 
 
326 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  42.67 
 
 
345 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  35.14 
 
 
303 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  28.35 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  30 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  25.76 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  28.57 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  26.45 
 
 
799 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  26.45 
 
 
799 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.46 
 
 
302 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.5 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.3 
 
 
222 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  30.53 
 
 
304 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  29.85 
 
 
302 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  32.14 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  29.27 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  30.21 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  26.52 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  25.29 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  29.13 
 
 
301 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  29.17 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  28.35 
 
 
305 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  30.53 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  31.78 
 
 
374 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  27.21 
 
 
291 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  27.21 
 
 
291 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  27.87 
 
 
306 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  28.04 
 
 
182 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  27.73 
 
 
193 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.46 
 
 
310 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  25.51 
 
 
171 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>