More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1995 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  78.09 
 
 		 2272 aa  658    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  90 
 
 		 2036 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  85.2 
 
 		 1842 aa  716    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  100 
 
 		 1882 aa  3726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  78.91 
 
 		 2122 aa  655    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  80.05 
 
 		 2000 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  79.06 
 
 		 978 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  80.24 
 
 		 1682 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  78.81 
 
 		 575 aa  648    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  91.52 
 
 		 1300 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  87.65 
 
 		 1969 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  83.78 
 
 		 1120 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  83.99 
 
 		 1241 aa  548  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  65.11 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  62.06 
 
 		 752 aa  506  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.67 
 
 		 1094 aa  447  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  54.73 
 
 		 1667 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  54.94 
 
 		 735 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.43 
 
 		 1356 aa  432  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  65.36 
 
 		 685 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  63.58 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  84.77 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  63.25 
 
 		 679 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  63.53 
 
 		 675 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  62.13 
 
 		 859 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  64.16 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  52.02 
 
 		 1361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  78.23 
 
 		 791 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.36 
 
 		 2554 aa  400  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.62 
 
 		 1862 aa  394  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  51.54 
 
 		 528 aa  389  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  76.23 
 
 		 581 aa  387  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  62.35 
 
 		 658 aa  380  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  76.73 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.53 
 
 		 963 aa  370  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  45.03 
 
 		 1282 aa  363  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.52 
 
 		 530 aa  363  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.82 
 
 		 941 aa  334  9e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.72 
 
 		 958 aa  334  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  29.83 
 
 		 1518 aa  331  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  49.51 
 
 		 930 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  65.08 
 
 		 615 aa  328  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.93 
 
 		 838 aa  314  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  43.81 
 
 		 1528 aa  298  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.61 
 
 		 460 aa  292  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  47.37 
 
 		 1667 aa  291  9e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  59.92 
 
 		 3295 aa  291  9e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.18 
 
 		 1236 aa  288  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.6 
 
 		 1732 aa  281  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.67 
 
 		 910 aa  279  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  82.93 
 
 		 184 aa  272  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.38 
 
 		 1387 aa  270  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  51.19 
 
 		 1052 aa  267  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1247 aa  255  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  48.02 
 
 		 861 aa  254  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.64 
 
 		 869 aa  253  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  70.52 
 
 		 560 aa  249  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.85 
 
 		 971 aa  242  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  70.99 
 
 		 644 aa  241  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  38.04 
 
 		 1011 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  33.49 
 
 		 460 aa  232  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.74 
 
 		 1292 aa  226  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.88 
 
 		 1783 aa  225  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.02 
 
 		 2176 aa  222  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.83 
 
 		 823 aa  219  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.15 
 
 		 443 aa  219  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  47.73 
 
 		 456 aa  215  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.86 
 
 		 930 aa  214  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.38 
 
 		 952 aa  211  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.71 
 
 		 840 aa  210  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.66 
 
 		 802 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.41 
 
 		 719 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  38.07 
 
 		 1814 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  60 
 
 		 1328 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.94 
 
 		 870 aa  200  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.66 
 
 		 929 aa  198  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.32 
 
 		 1531 aa  195  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.53 
 
 		 2552 aa  194  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.49 
 
 		 845 aa  192  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  42.03 
 
 		 395 aa  187  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 		 786 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.5 
 
 		 439 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 777 aa  185  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.17 
 
 		 819 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  36 
 
 		 458 aa  184  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.89 
 
 		 1987 aa  183  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  30.39 
 
 		 1732 aa  182  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.54 
 
 		 2495 aa  180  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  52.82 
 
 		 519 aa  179  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.57 
 
 		 1095 aa  179  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.01 
 
 		 865 aa  176  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.4 
 
 		 1189 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  25.23 
 
 		 2392 aa  173  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.19 
 
 		 1380 aa  171  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.84 
 
 		 816 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.7 
 
 		 938 aa  168  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 1606 aa  165  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  40.5 
 
 		 352 aa  163  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  29.77 
 
 		 730 aa  162  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  42.31 
 
 		 408 aa  162  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>