More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1993 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  81.86 
 
 		 1300 aa  1176    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  72.49 
 
 		 2272 aa  2214    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  94.24 
 
 		 2036 aa  2933    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  61.94 
 
 		 1241 aa  864    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  100 
 
 		 1969 aa  3997    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  87.05 
 
 		 978 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  87.65 
 
 		 1882 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  85.8 
 
 		 1120 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  86.75 
 
 		 1682 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  84.94 
 
 		 2122 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  85.54 
 
 		 2000 aa  572  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  81.41 
 
 		 1842 aa  560  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  84.64 
 
 		 575 aa  560  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  55.98 
 
 		 809 aa  467  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  68.47 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  67.98 
 
 		 752 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  47.48 
 
 		 1328 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  84.36 
 
 		 547 aa  413  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  61.84 
 
 		 685 aa  406  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  44.34 
 
 		 1067 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.18 
 
 		 713 aa  400  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  63.17 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  60.11 
 
 		 859 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  63.66 
 
 		 669 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  78.23 
 
 		 791 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  63.47 
 
 		 675 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  59.44 
 
 		 735 aa  386  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  74.8 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  59.66 
 
 		 1094 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  77.14 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.33 
 
 		 1311 aa  367  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  61.98 
 
 		 658 aa  360  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  53.74 
 
 		 1356 aa  345  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.36 
 
 		 1667 aa  343  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  44.19 
 
 		 834 aa  334  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  41.06 
 
 		 556 aa  332  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  65.18 
 
 		 615 aa  321  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.53 
 
 		 2554 aa  317  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49.86 
 
 		 1361 aa  316  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  46.08 
 
 		 797 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.65 
 
 		 528 aa  306  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.62 
 
 		 963 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.42 
 
 		 1282 aa  296  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.55 
 
 		 1862 aa  296  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.21 
 
 		 530 aa  294  9e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.82 
 
 		 930 aa  294  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  45.52 
 
 		 497 aa  288  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  58.33 
 
 		 3295 aa  284  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  58.43 
 
 		 1732 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 460 aa  279  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  39 
 
 		 656 aa  275  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  46.15 
 
 		 941 aa  275  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.3 
 
 		 910 aa  273  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  83.54 
 
 		 184 aa  270  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.88 
 
 		 958 aa  259  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.32 
 
 		 1528 aa  251  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  71.68 
 
 		 560 aa  250  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.78 
 
 		 1236 aa  250  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  48.79 
 
 		 1667 aa  250  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  44 
 
 		 838 aa  249  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.01 
 
 		 861 aa  241  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  42.29 
 
 		 1292 aa  240  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  46.2 
 
 		 971 aa  238  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  69.75 
 
 		 644 aa  233  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  45.63 
 
 		 1387 aa  228  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.77 
 
 		 869 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.86 
 
 		 930 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.65 
 
 		 1009 aa  213  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.11 
 
 		 840 aa  202  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.48 
 
 		 443 aa  201  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.06 
 
 		 823 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 		 802 aa  196  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.05 
 
 		 1783 aa  195  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.01 
 
 		 870 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  35.09 
 
 		 612 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.93 
 
 		 952 aa  192  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 		 719 aa  191  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.2 
 
 		 929 aa  188  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  40.43 
 
 		 1011 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.39 
 
 		 2176 aa  186  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.56 
 
 		 786 aa  184  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.08 
 
 		 2552 aa  184  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.65 
 
 		 845 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  36.05 
 
 		 439 aa  181  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.78 
 
 		 938 aa  181  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 777 aa  180  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.95 
 
 		 1095 aa  179  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 		 819 aa  179  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  33.41 
 
 		 635 aa  179  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.24 
 
 		 1531 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  49.74 
 
 		 519 aa  173  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  38.41 
 
 		 1814 aa  171  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.8 
 
 		 1380 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.29 
 
 		 1189 aa  164  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  32.37 
 
 		 626 aa  163  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  42.31 
 
 		 408 aa  162  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.06 
 
 		 1931 aa  161  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  34.77 
 
 		 940 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  37.61 
 
 		 960 aa  159  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  49.07 
 
 		 500 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>