More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1991 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  44.7 
 
 		 1328 aa  990    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  100 
 
 		 1311 aa  2660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.47 
 
 		 1241 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  44.29 
 
 		 1300 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.05 
 
 		 2036 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.33 
 
 		 1969 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.75 
 
 		 2272 aa  337  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  46.92 
 
 		 809 aa  304  9e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.86 
 
 		 1842 aa  285  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  36.95 
 
 		 656 aa  262  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  42.78 
 
 		 497 aa  261  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1067 aa  251  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  39.58 
 
 		 797 aa  247  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  35.66 
 
 		 556 aa  229  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.28 
 
 		 2122 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  33.4 
 
 		 612 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.31 
 
 		 1009 aa  173  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1682 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  35.55 
 
 		 635 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  33.78 
 
 		 626 aa  158  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 		 834 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  50.91 
 
 		 791 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.1 
 
 		 713 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.1 
 
 		 658 aa  141  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.15 
 
 		 669 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  48.48 
 
 		 184 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  49.12 
 
 		 1356 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49.7 
 
 		 1120 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  41.71 
 
 		 685 aa  139  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  47.67 
 
 		 735 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  49.7 
 
 		 1094 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50.9 
 
 		 581 aa  138  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  44.04 
 
 		 615 aa  138  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  49.71 
 
 		 560 aa  137  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  45.11 
 
 		 551 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.14 
 
 		 679 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  44.12 
 
 		 675 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  49.7 
 
 		 3295 aa  136  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.96 
 
 		 752 aa  136  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  48.48 
 
 		 561 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.88 
 
 		 2554 aa  135  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  47.27 
 
 		 859 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  47.09 
 
 		 978 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  46.51 
 
 		 575 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.93 
 
 		 547 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  35.07 
 
 		 484 aa  133  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.9 
 
 		 1882 aa  132  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  46.51 
 
 		 2000 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  46.67 
 
 		 963 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.81 
 
 		 1361 aa  129  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  46.06 
 
 		 644 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.78 
 
 		 1862 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.77 
 
 		 1667 aa  129  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  43.79 
 
 		 1528 aa  128  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.13 
 
 		 1236 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.05 
 
 		 1732 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.82 
 
 		 930 aa  127  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44.31 
 
 		 1931 aa  126  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.64 
 
 		 845 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.18 
 
 		 941 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.18 
 
 		 1667 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  45.29 
 
 		 1282 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.65 
 
 		 528 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42 
 
 		 802 aa  123  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  47.22 
 
 		 996 aa  123  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  42.46 
 
 		 1231 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.69 
 
 		 819 aa  121  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 		 719 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  43.35 
 
 		 816 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  34.6 
 
 		 840 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  44.85 
 
 		 910 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.71 
 
 		 870 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.37 
 
 		 786 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.49 
 
 		 929 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41.71 
 
 		 861 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.91 
 
 		 519 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.45 
 
 		 530 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.98 
 
 		 1292 aa  115  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  48.1 
 
 		 408 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.88 
 
 		 838 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.05 
 
 		 2552 aa  111  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.38 
 
 		 823 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  39.77 
 
 		 500 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.24 
 
 		 958 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.95 
 
 		 460 aa  109  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1001 aa  108  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.5 
 
 		 1812 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.11 
 
 		 819 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.79 
 
 		 1095 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  42.42 
 
 		 769 aa  105  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.62 
 
 		 930 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  39.11 
 
 		 400 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.76 
 
 		 1387 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35 
 
 		 971 aa  101  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.95 
 
 		 869 aa  102  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  41.01 
 
 		 961 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 1783 aa  99.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.64 
 
 		 439 aa  98.6  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  35.26 
 
 		 848 aa  98.2  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.72 
 
 		 777 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>