More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1990 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  73.36 
 
 		 2272 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  87.83 
 
 		 2036 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  100 
 
 		 1842 aa  3680    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  59.54 
 
 		 1882 aa  902    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  77.54 
 
 		 2122 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  76.81 
 
 		 2000 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  77.21 
 
 		 978 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  76.62 
 
 		 1682 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  80.86 
 
 		 575 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  87.25 
 
 		 1300 aa  612  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  81.41 
 
 		 1969 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  84.59 
 
 		 1241 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  59.53 
 
 		 561 aa  548  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  81.19 
 
 		 1120 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  54.92 
 
 		 1094 aa  516  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  52.17 
 
 		 1667 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  63.77 
 
 		 752 aa  503  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  51.15 
 
 		 1361 aa  486  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  58.16 
 
 		 1356 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.59 
 
 		 1862 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  54.84 
 
 		 735 aa  443  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.07 
 
 		 1282 aa  443  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.12 
 
 		 963 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  64.16 
 
 		 685 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.64 
 
 		 2554 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.23 
 
 		 1328 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  52.49 
 
 		 528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  63.1 
 
 		 669 aa  406  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  61.45 
 
 		 679 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  62.1 
 
 		 675 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  81.07 
 
 		 547 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46.68 
 
 		 1236 aa  403  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  62.05 
 
 		 713 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  58.54 
 
 		 859 aa  394  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  75.4 
 
 		 791 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  73.23 
 
 		 581 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.65 
 
 		 941 aa  380  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.23 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  62.05 
 
 		 658 aa  373  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.7 
 
 		 838 aa  367  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  75.51 
 
 		 551 aa  366  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  43.17 
 
 		 1528 aa  356  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  45.44 
 
 		 930 aa  350  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  47.45 
 
 		 1667 aa  347  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  48.72 
 
 		 1732 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.27 
 
 		 958 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.89 
 
 		 615 aa  318  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  38.04 
 
 		 1311 aa  317  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.62 
 
 		 1387 aa  313  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.28 
 
 		 460 aa  300  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  58.82 
 
 		 3295 aa  290  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  39.86 
 
 		 656 aa  286  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  44.32 
 
 		 612 aa  278  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  80.23 
 
 		 184 aa  277  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50.3 
 
 		 861 aa  273  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  37.34 
 
 		 1011 aa  273  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.32 
 
 		 910 aa  271  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.4 
 
 		 971 aa  255  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  69.57 
 
 		 560 aa  253  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  35.75 
 
 		 952 aa  252  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.58 
 
 		 869 aa  249  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.56 
 
 		 1783 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.43 
 
 		 2176 aa  244  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  34.83 
 
 		 865 aa  231  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  64.67 
 
 		 644 aa  231  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  36.93 
 
 		 1814 aa  226  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  39.12 
 
 		 626 aa  226  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.54 
 
 		 823 aa  225  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.08 
 
 		 1292 aa  225  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.15 
 
 		 719 aa  220  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.92 
 
 		 840 aa  219  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.95 
 
 		 870 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.43 
 
 		 802 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.2 
 
 		 845 aa  212  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.36 
 
 		 1009 aa  211  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  38.9 
 
 		 635 aa  211  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.47 
 
 		 930 aa  207  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.22 
 
 		 929 aa  207  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  36.14 
 
 		 809 aa  206  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.78 
 
 		 443 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1052 aa  204  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1067 aa  203  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.11 
 
 		 1531 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.97 
 
 		 1606 aa  202  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.89 
 
 		 1620 aa  196  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.87 
 
 		 786 aa  195  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  45.21 
 
 		 777 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.31 
 
 		 2552 aa  193  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.28 
 
 		 439 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.98 
 
 		 819 aa  188  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.23 
 
 		 1095 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.8 
 
 		 1987 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  32.96 
 
 		 484 aa  184  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1247 aa  184  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  35.62 
 
 		 1602 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.33 
 
 		 938 aa  184  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  32.77 
 
 		 834 aa  182  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  32.48 
 
 		 797 aa  178  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  41.03 
 
 		 395 aa  176  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.68 
 
 		 1189 aa  171  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>