More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1989 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  61.41 
 
 		 1328 aa  1172    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  61 
 
 		 1300 aa  927    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  48.03 
 
 		 2036 aa  827    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  100 
 
 		 1241 aa  2512    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  61.94 
 
 		 1969 aa  866    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  47.86 
 
 		 2272 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  37.47 
 
 		 1311 aa  598  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  82.27 
 
 		 1120 aa  562  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  84.85 
 
 		 2122 aa  562  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  84.85 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  84.59 
 
 		 1842 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  82.73 
 
 		 978 aa  551  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  83.99 
 
 		 1882 aa  549  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  81.82 
 
 		 2000 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  81.82 
 
 		 1682 aa  539  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  70.71 
 
 		 561 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  82.72 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  66.16 
 
 		 752 aa  405  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  62.72 
 
 		 685 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  56.78 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  60.77 
 
 		 859 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  77.02 
 
 		 791 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  59.83 
 
 		 679 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  62.16 
 
 		 713 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  72.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  47.11 
 
 		 656 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  59.94 
 
 		 675 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  58.72 
 
 		 735 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  58.36 
 
 		 1094 aa  360  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  61.05 
 
 		 658 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  73.68 
 
 		 551 aa  357  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.97 
 
 		 1667 aa  333  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  53.59 
 
 		 1356 aa  333  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.96 
 
 		 2554 aa  328  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49.34 
 
 		 1361 aa  325  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  62.35 
 
 		 615 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  49.43 
 
 		 530 aa  307  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.35 
 
 		 528 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.35 
 
 		 1282 aa  296  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.81 
 
 		 1862 aa  295  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  40.18 
 
 		 612 aa  292  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  48.84 
 
 		 963 aa  288  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.94 
 
 		 3295 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  49.26 
 
 		 460 aa  284  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  40.46 
 
 		 797 aa  283  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  36.21 
 
 		 556 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  58.04 
 
 		 1732 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.25 
 
 		 910 aa  275  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  77.47 
 
 		 184 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.73 
 
 		 941 aa  260  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  29.4 
 
 		 809 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  46.53 
 
 		 1528 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.12 
 
 		 958 aa  251  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  48.25 
 
 		 1236 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.28 
 
 		 930 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  40.76 
 
 		 635 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.06 
 
 		 1667 aa  245  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  71.26 
 
 		 560 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.96 
 
 		 838 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.45 
 
 		 861 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  37.32 
 
 		 1067 aa  232  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  69.14 
 
 		 644 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.88 
 
 		 971 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  37.38 
 
 		 497 aa  221  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.29 
 
 		 869 aa  221  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.03 
 
 		 1387 aa  219  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  37.12 
 
 		 626 aa  217  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.12 
 
 		 1292 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.08 
 
 		 930 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  40.62 
 
 		 1783 aa  206  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  38.84 
 
 		 840 aa  205  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 823 aa  204  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.27 
 
 		 802 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 870 aa  195  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.53 
 
 		 719 aa  193  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.12 
 
 		 2552 aa  192  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  33.49 
 
 		 834 aa  191  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.21 
 
 		 786 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 		 845 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.04 
 
 		 1009 aa  190  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.87 
 
 		 443 aa  190  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.02 
 
 		 952 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 777 aa  185  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.17 
 
 		 819 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.4 
 
 		 938 aa  182  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  39.76 
 
 		 1011 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.44 
 
 		 1531 aa  181  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37 
 
 		 439 aa  178  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.1 
 
 		 929 aa  178  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.49 
 
 		 2176 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  49.21 
 
 		 519 aa  174  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.95 
 
 		 1095 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.8 
 
 		 1814 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 		 1380 aa  170  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  43.02 
 
 		 408 aa  165  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  38.55 
 
 		 1189 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 		 484 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  30.84 
 
 		 430 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  49.71 
 
 		 816 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.29 
 
 		 1931 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>