89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1982 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  47.39 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  32.61 
 
 
287 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  28.36 
 
 
295 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.14 
 
 
286 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
280 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
279 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.63 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  26.17 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  27.17 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  46 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.03 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.63 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  25.78 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  23.84 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  26.82 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.57 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.27 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.27 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  21.99 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  21.9 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  23.67 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.6 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.65 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  26.54 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.13 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  21.29 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  34.04 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  25.54 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  27.75 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.31 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  25.77 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  24.36 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  23.32 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  33.71 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  23.33 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  23.33 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  23.93 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  26.64 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  23.22 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  22.75 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  22.69 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.58 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  26.17 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  23.25 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  38.16 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  26.89 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.03 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  23.08 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  24.43 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  21.43 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  21.96 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  23.96 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  21.33 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  25.37 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  22.13 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  22.05 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  24.41 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.69 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  31.3 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 
259 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.13 
 
 
352 aa  45.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
267 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3103  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 
275 aa  45.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00714601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.32 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.33 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.7 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1480  RNA methyltransferase, TrmA family  30.21 
 
 
442 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.07 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  32.67 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  24.79 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
265 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.95 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  35 
 
 
249 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  23.45 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  33.72 
 
 
225 aa  42  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
190 aa  42  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>