More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1965 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  100 
 
 		 604 aa  1243    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  51.19 
 
 		 617 aa  617  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  51.78 
 
 		 618 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  51.83 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  50.95 
 
 		 620 aa  585  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  46.97 
 
 		 622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  41.68 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  40.53 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  41.17 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  41.17 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  41.37 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  50 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  40.11 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  38.68 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 557 aa  362  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 557 aa  356  6.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 682 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 547 aa  303  5.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 791 aa  295  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 542 aa  294  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 654 aa  294  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.15 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 671 aa  294  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 749 aa  293  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  40.32 
 
 		 628 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 549 aa  290  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 551 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  40.69 
 
 		 692 aa  287  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  39.1 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 640 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 797 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  35.7 
 
 		 556 aa  280  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 1255 aa  279  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  40.05 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 847 aa  276  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 831 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.28 
 
 		 583 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 991 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  31.47 
 
 		 722 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 1335 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 1319 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 519 aa  253  5.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.88 
 
 		 770 aa  246  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 577 aa  237  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 612 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.23 
 
 		 552 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 311 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  32.02 
 
 		 515 aa  174  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 445 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.98 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.9 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 466 aa  170  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 458 aa  170  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  29.98 
 
 		 467 aa  170  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.89 
 
 		 521 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 463 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.74 
 
 		 438 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.73 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.75 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.02 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.74 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.5 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 412 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.4 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.7 
 
 		 445 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 467 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.34 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  29.95 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32.4 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 498 aa  161  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>