36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1936 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  48.45 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  31.77 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  29.95 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  31.98 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  29.76 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  28.09 
 
 
410 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  30.2 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  29.95 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25 
 
 
227 aa  58.2  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  30.6 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  31.06 
 
 
387 aa  54.7  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 
236 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  28.28 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  27.41 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1986  dolichol kinase-like protein  27.88 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00109651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0270  hypothetical protein  31.73 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0030  phosphatidate cytidylyltransferase  25.77 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0036147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  22.39 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  38.3 
 
 
217 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  30.53 
 
 
225 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  35.61 
 
 
444 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  29.33 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  26.7 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  35.94 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  23.33 
 
 
381 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  33.7 
 
 
526 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>