More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1888 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  85.07 
 
 		 68 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  46.97 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  46.97 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  50 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  48.48 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.54 
 
 		 954 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45.16 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  49.18 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.9 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  43.55 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 942 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  41.94 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  46.97 
 
 		 742 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  43.55 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  46.88 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  53.33 
 
 		 826 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 832 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  40.98 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 867 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  40.98 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  39.34 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 824 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 976 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 815 aa  57.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 836 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40.32 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  38.71 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  43.55 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 832 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 816 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 798 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 798 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 		 94 aa  57  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 890 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 827 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 861 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 841 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 838 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 826 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 837 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 753 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  44.83 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  39.34 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 759 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 889 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 889 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  39.34 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0802  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  39.34 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 		 838 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 837 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 830 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40 
 
 		 819 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 798 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  35.48 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 836 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 750 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  39.06 
 
 		 799 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1087 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 839 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 797 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 835 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 817 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  37.1 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 795 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 757 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 744 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  37.7 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  37.7 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  42.86 
 
 		 817 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 827 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>