298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1817 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  100 
 
 
493 aa  984    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.25 
 
 
1343 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  34.52 
 
 
1094 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  33.63 
 
 
644 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.25 
 
 
1148 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 
1181 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  31.05 
 
 
958 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  35.38 
 
 
501 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.83 
 
 
1224 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.2 
 
 
490 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.48 
 
 
1139 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.15 
 
 
1438 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
395 aa  127  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.92 
 
 
959 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.9 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.81 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.8 
 
 
1412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.74 
 
 
323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.22 
 
 
192 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  33.2 
 
 
431 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.75 
 
 
1328 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.44 
 
 
320 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.09 
 
 
390 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.85 
 
 
524 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.73 
 
 
1133 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  30.31 
 
 
321 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.42 
 
 
323 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.75 
 
 
208 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.42 
 
 
319 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.02 
 
 
313 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.11 
 
 
319 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.87 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  27.59 
 
 
395 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  28.94 
 
 
517 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.59 
 
 
395 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  33.68 
 
 
886 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.74 
 
 
667 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 
180 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.46 
 
 
331 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.95 
 
 
666 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 
321 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 
302 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  27.16 
 
 
320 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.75 
 
 
176 aa  90.1  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.58 
 
 
838 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.2 
 
 
232 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.63 
 
 
321 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.09 
 
 
200 aa  86.7  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.4 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.58 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.28 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.47 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  26.08 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.69 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.35 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.31 
 
 
331 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.26 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
593 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.36 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.94 
 
 
670 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.74 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  31.28 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  27.15 
 
 
316 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.81 
 
 
157 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.85 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.95 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 
223 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.76 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.5 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  26.2 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.52 
 
 
1194 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 
515 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.19 
 
 
246 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.1 
 
 
223 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 
220 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.9 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  29.2 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.78 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.52 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.52 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.53 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.53 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  26.53 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  33.97 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.52 
 
 
214 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  27.04 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  40.54 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3776  HEAT domain containing protein  40.54 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000557068  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.98 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  34.07 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 
1041 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.71 
 
 
220 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.33 
 
 
642 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>