More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1802 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  49.17 
 
 		 1328 aa  741    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  75.07 
 
 		 1300 aa  1068    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  72.62 
 
 		 2272 aa  2349    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  100 
 
 		 2036 aa  4140    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  48.23 
 
 		 1241 aa  830    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  87.41 
 
 		 1842 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  94.24 
 
 		 1969 aa  2931    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  90 
 
 		 1882 aa  754    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  79.43 
 
 		 2122 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  77.46 
 
 		 2000 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  79.24 
 
 		 1682 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  80 
 
 		 575 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  77.43 
 
 		 978 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  84.18 
 
 		 1120 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  65.43 
 
 		 561 aa  522  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  63.94 
 
 		 752 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  56.39 
 
 		 809 aa  465  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.88 
 
 		 1094 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.05 
 
 		 1356 aa  440  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  34.23 
 
 		 1311 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  53.51 
 
 		 1667 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  54.5 
 
 		 735 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  65.66 
 
 		 685 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  84.36 
 
 		 547 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  64.16 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  63.55 
 
 		 679 aa  413  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  63.99 
 
 		 669 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  50.7 
 
 		 656 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  62.97 
 
 		 675 aa  406  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50.57 
 
 		 1361 aa  407  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  62.92 
 
 		 859 aa  403  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  80.24 
 
 		 791 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  54.69 
 
 		 2554 aa  400  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  45.2 
 
 		 1067 aa  400  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  51.13 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  63.25 
 
 		 658 aa  384  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  74.8 
 
 		 581 aa  383  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.6 
 
 		 1862 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  78.14 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.41 
 
 		 963 aa  366  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  44.31 
 
 		 1282 aa  366  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.28 
 
 		 530 aa  358  7.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  44.19 
 
 		 834 aa  333  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.4 
 
 		 941 aa  331  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  40.97 
 
 		 556 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  66.4 
 
 		 615 aa  324  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  47.01 
 
 		 612 aa  324  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 958 aa  318  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.91 
 
 		 930 aa  318  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  46.08 
 
 		 797 aa  316  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.39 
 
 		 1236 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.79 
 
 		 838 aa  305  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  43.17 
 
 		 1528 aa  297  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  44.26 
 
 		 1667 aa  292  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  49.71 
 
 		 460 aa  292  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  58.66 
 
 		 3295 aa  289  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  45.52 
 
 		 497 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.97 
 
 		 910 aa  282  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  58.82 
 
 		 1732 aa  280  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.06 
 
 		 1387 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  78.57 
 
 		 184 aa  275  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.67 
 
 		 861 aa  254  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.58 
 
 		 869 aa  252  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  71.26 
 
 		 560 aa  245  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  44.41 
 
 		 971 aa  242  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  39.92 
 
 		 635 aa  236  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  70.99 
 
 		 644 aa  234  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.8 
 
 		 823 aa  231  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.48 
 
 		 1292 aa  231  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.74 
 
 		 1783 aa  227  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  49.03 
 
 		 930 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.92 
 
 		 840 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  37.88 
 
 		 1011 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.57 
 
 		 719 aa  218  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.47 
 
 		 802 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  35.38 
 
 		 952 aa  217  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.78 
 
 		 443 aa  214  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.38 
 
 		 870 aa  214  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  38.82 
 
 		 626 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.65 
 
 		 1009 aa  212  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.98 
 
 		 2176 aa  210  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.19 
 
 		 845 aa  209  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.01 
 
 		 1531 aa  206  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.76 
 
 		 1814 aa  205  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.53 
 
 		 2552 aa  198  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.65 
 
 		 786 aa  196  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.07 
 
 		 777 aa  191  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.9 
 
 		 819 aa  190  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.66 
 
 		 929 aa  188  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.12 
 
 		 439 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.41 
 
 		 865 aa  185  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.46 
 
 		 1987 aa  183  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  45.83 
 
 		 938 aa  180  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  49.74 
 
 		 519 aa  179  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.87 
 
 		 1189 aa  176  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.57 
 
 		 1095 aa  175  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.41 
 
 		 1380 aa  174  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.84 
 
 		 816 aa  169  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.88 
 
 		 1606 aa  168  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  32.5 
 
 		 484 aa  163  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>