More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1798 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  100 
 
 
1300 aa  2629    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  66.03 
 
 
2272 aa  922    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  75.07 
 
 
2036 aa  1069    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  61 
 
 
1241 aa  927    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  81.86 
 
 
1969 aa  1176    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  91.52 
 
 
1882 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  87.25 
 
 
1842 aa  611  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  50.75 
 
 
1328 aa  572  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  84.32 
 
 
1120 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  85.24 
 
 
1682 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  83.73 
 
 
2000 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  83.73 
 
 
978 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  84.04 
 
 
575 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  82.53 
 
 
2122 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  70.97 
 
 
561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  71.12 
 
 
752 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.29 
 
 
1311 aa  436  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  63.59 
 
 
685 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  64.46 
 
 
679 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  65.86 
 
 
669 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  63.08 
 
 
713 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  64.16 
 
 
675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  83.13 
 
 
547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  53.99 
 
 
735 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  59.61 
 
 
859 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  60.77 
 
 
1094 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  77.82 
 
 
791 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  75.59 
 
 
581 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  62.65 
 
 
658 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  78.37 
 
 
551 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  56.55 
 
 
1667 aa  363  8e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  56.12 
 
 
1356 aa  355  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  52.98 
 
 
1361 aa  352  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50.14 
 
 
528 aa  328  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  65.08 
 
 
615 aa  324  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.14 
 
 
1282 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  54.73 
 
 
2554 aa  321  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  50 
 
 
1862 aa  318  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  52.07 
 
 
963 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  40.39 
 
 
556 aa  299  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  45.14 
 
 
797 aa  298  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.5 
 
 
530 aa  295  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.85 
 
 
3295 aa  292  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50.3 
 
 
460 aa  290  9e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  46.22 
 
 
941 aa  283  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  56.49 
 
 
1732 aa  279  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.68 
 
 
910 aa  278  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.47 
 
 
930 aa  275  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.76 
 
 
958 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  76.92 
 
 
184 aa  271  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  43.26 
 
 
497 aa  267  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  40.3 
 
 
1067 aa  264  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  41.67 
 
 
809 aa  263  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.62 
 
 
1528 aa  263  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.91 
 
 
838 aa  258  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  73.56 
 
 
560 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.89 
 
 
861 aa  254  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  48.48 
 
 
1667 aa  251  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  47.01 
 
 
971 aa  251  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.08 
 
 
1236 aa  251  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  45.74 
 
 
1387 aa  245  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.64 
 
 
869 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  42.24 
 
 
1292 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  66.3 
 
 
644 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.41 
 
 
823 aa  224  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.44 
 
 
1783 aa  222  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 
840 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  48.64 
 
 
930 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.27 
 
 
719 aa  214  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.88 
 
 
443 aa  212  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.96 
 
 
802 aa  211  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.55 
 
 
952 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 
870 aa  204  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.3 
 
 
845 aa  201  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.47 
 
 
2176 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.46 
 
 
439 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  48.18 
 
 
1095 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  40.43 
 
 
1011 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.76 
 
 
786 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  45.31 
 
 
2552 aa  190  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.31 
 
 
929 aa  188  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.74 
 
 
777 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.16 
 
 
819 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  39.87 
 
 
1531 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  39.57 
 
 
1814 aa  180  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  41.46 
 
 
938 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  50.79 
 
 
519 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.87 
 
 
1189 aa  174  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.84 
 
 
1380 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.84 
 
 
816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  45.09 
 
 
960 aa  166  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  42.69 
 
 
408 aa  162  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.86 
 
 
1931 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  43.41 
 
 
848 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.52 
 
 
865 aa  157  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  36.15 
 
 
1987 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.45 
 
 
500 aa  154  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  54.24 
 
 
996 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.35 
 
 
1602 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40.32 
 
 
821 aa  148  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>