227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1796 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  100 
 
 		 497 aa  1009    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  44.53 
 
 		 809 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  45.52 
 
 		 2036 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  45.52 
 
 		 1969 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.26 
 
 		 1300 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  42.78 
 
 		 1311 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  40.67 
 
 		 797 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  36.83 
 
 		 556 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  39.22 
 
 		 2272 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  37.44 
 
 		 1328 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  37.38 
 
 		 1241 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1067 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  32.55 
 
 		 1812 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.44 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 963 aa  87  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  31.28 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.2 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.11 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 687 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  30.47 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.02 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  26.27 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  32.67 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  27.03 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.79 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.51 
 
 		 653 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 795 aa  70.1  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.67 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  24.63 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.49 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 705 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 652 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.88 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.61 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  26.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.61 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.45 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.22 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.27 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.22 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  29.32 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  23.3 
 
 		 1009 aa  63.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.01 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.01 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.23 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.21 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.93 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.22 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  28.41 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  33.93 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.53 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.38 
 
 		 1454 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.66 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.51 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  27.45 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  26.11 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  32.57 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.77 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 444 aa  57  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  28.57 
 
 		 961 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1682 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 		 619 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.91 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  32.08 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.5 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.5 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  21.67 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.31 
 
 		 611 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  30.19 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  29.56 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  24.85 
 
 		 593 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 774 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.2 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>